יש לסווג את האחסון של כלי זכוכית מזכוכית לקטגוריות שונות לגישה נוחה. להלן כמה הצעות מ-WUBOLAB, איש מקצוע יצרן כלי זכוכית במעבדה.
יש להניח את הפיפטה בקופסה חסינת אבק לאחר הניקוי.
השמיים בורט מעבדה נשטף במים טהורים, מלא במים טהורים, מכוסה במבחנה קצרה מזכוכית או בשרוול פלסטיק, ומהדקים על מהדק הבורטה.
שטפו את הקובטה לאחר השימוש, הניחו את נייר הסינון על צלחת פורצלן קטנה או צלחת פלסטיק, הפכו אותה וייבשו אותה, לאחר מכן הניחו אותה בקופסת קובטות או בכלי נקי.
מומלץ להשתמש בחוט או חוט פלסטיק כדי לחטט בפקק ובבקבוק לפני הניקוי כדי למנוע שבירת הפקק או ערבוב בעת שטיפת כלי זכוכית במטחנות, כגון צלוחיות נפח, שפופרות קולורימטריות וכו'.
טחינת כלי זכוכית שצריך לאחסן לאורך זמן יש לרפד בפיסת נייר בפקק ובפה הטחינה כדי למנוע הידבקות.
יש להסיר בורטות שאינן בשימוש לטווח ארוך, וזלין, לרפד בנייר ולאחסן עם בוכנה קשורה בגומייה. אין לסובב את פקקי הטחנה בחוזקה כאשר יש גרגרי חול, כמו כן אל תשתמש בחומר ניקוי כדי לקרצף את הפה הטחינה, כדי לא להפחית את דיוקו.
סטים שלמים של כלי זכוכית כגון חולצי סוקסלט, מנתחי גז וכו' יש לשטוף מיד ולאחסן בקופסה ייעודית.