Dujų chromatografija dažnai trunka 24 valandas, nes reikia nuolatinės gamybos. Sunku turėti galimybę sistemingai valyti ir prižiūrėti instrumentą. Kai tik yra tinkama galimybė, būtina kuo geriau išvalyti ir prižiūrėti pagrindinius instrumento komponentus pagal faktines