Gaschromatografie duurt vaak 24 uur vanwege de noodzaak van continue productie. Het is moeilijk om de mogelijkheid te hebben om het instrument systematisch schoon te maken en te onderhouden. Zodra er een geschikte gelegenheid is, is het noodzakelijk om de belangrijkste onderdelen van het instrument zoveel mogelijk grondig schoon te maken en te onderhouden volgens de werkelijke omstandigheden.