由於連續生產的需要，氣相層析儀常常24小時運作。很難有機會有系統地清潔和維護儀器。一旦有合適的機會，就要根據儀器的實際操作情況，盡可能對儀器的關鍵部件進行徹底的清潔和保養。
氣相層析儀常用於有機物的定量分析。儀器運作一段時間後，由於靜電的作用，儀器內部容易吸附較多的灰塵。灰塵除了積聚在電路板和電路板插座內外，還常常與某些有機蒸氣吸附在一起；由於某些有機物的凝固點較低，因此在入口位置經常會發現凝固的有機物。劈裂線使用一段時間後，內徑變細，甚至被有機物堵塞；在使用過程中，TCD檢測器很可能被有機物污染； FID檢測器長期用於有機分析，在噴嘴或收集器位置經常會出現有機物沉積，或噴嘴和收集器部分積碳的現象。
1.儀器內部的吹掃與清潔
氣相層析儀停止後，打開儀器的側面板和後面板，用儀器空氣或氮氣淨化儀器內部的灰塵，並用軟毛刷處理灰塵或不易清潔的地方。吹掃完成後，用水或有機溶劑對儀器內部有機物污染的地方進行擦洗。水溶性有機物可先用水擦拭，無法徹底清洗的地方可用有機溶劑。它不溶於水或不可能。與水發生化學反應的有機物以不與其反應的有機溶劑清洗，如甲苯、丙酮、四氯化碳等。注意擦拭儀器時不得對儀器表面或其他零件造成腐蝕或二次污染。
2、電路板的維護與清潔
在氣相層析儀準備維護之前，請關閉儀器電源。首先，用儀表空氣或氮氣吹掃電路板和板槽。使用軟刷清潔電路板和插槽的灰塵部分。仔細清理它。操作時盡量戴手套，防止手上的靜電或汗水影響板上的某些元件。
吹掃完成後，應仔細觀察電路板，看印刷電路板或電子元件是否有明顯腐蝕。用脫脂棉擦拭板上被有機物污染的電子元件和印刷電路，並擦拭板子介面和插座。
3.進料口的清潔
檢查時需對玻璃內膽、分流板、進樣口進水管線、EPC進行清洗。
玻璃襯管和分流板的清潔：小心地將玻璃襯管從儀器上取下，並用鑷子或其他小工具小心地清除襯管上的玻璃棉和其他雜質。拆卸過程中請勿刮傷內襯表面。
如果條件允許，可以將原先清洗過的玻璃內膽在有機溶劑中用超音波清洗，並乾燥後備用。也可以直接用丙酮、甲苯等有機溶劑洗滌，乾燥後再使用。
分體板最理想的清洗方法是在溶劑中超音波處理，並在乾燥後使用。也可以選擇適當的有機溶劑進行清洗：將分流板從入口取出後，先用甲苯等惰性溶劑清洗，再用甲醇等醇類溶劑清洗，乾燥。
分流管的清洗：氣相層析儀用於有機物和高分子化合物分析時，許多有機物的凝固點較低，在從樣品中排出樣品的過程中，部分有機物會在分流管中凝固。化室。
氣相層析儀經過長時間的使用後，分流線內徑逐漸變小，甚至完全阻塞。分流線阻塞後，儀器進樣口壓力異常，峰形變差，分析結果異常。在檢修過程中，無論是否能夠確定分流線是否堵塞，都需要對分流線進行清理。分流管路的清洗一般選用丙酮、甲苯等有機溶劑。對於堵塞嚴重的分流管，單純的清洗是很難清洗乾淨的，需要其他一些輔助的機械方法才能完成。分流線可以透過選擇合適粗細的導線來簡單疏通，然後用丙酮或甲苯等有機溶劑清洗。由於事先對分流部分的狀況不易做出準確的判斷，因此手分氣相層析儀在檢修過程中需要對分流管路進行清洗。
對於EPC控制分流氣相層析儀，由於長期使用，有可能將一些小樣品插入EPC與氣體管路介面處，隨時可能造成阻塞或入口壓力變化。因此，每次進行檢查過程時，都要用甲苯或丙酮等有機溶劑對儀器的EPC部分進行檢查和清洗，然後乾燥。
由於注入等原因，進口外部隨時可能形成部分有機物。可用丙酮、甲苯等對吸收體的入口進行初步擦拭，然後機械去除無法擦拭掉的有機物。小心清除凝固的有機物，不要損壞儀器元件。除去固化的有機物後，用有機溶劑仔細擦拭儀器零件。
4. TCD和FID檢測器的清潔
TCD 偵測器可能會被使用過程中色譜管柱中的沉積物或樣本中夾帶的其他物質污染。一旦 TCD 偵測器被污染，儀器的基線就會出現抖動並增加噪音。有必要清潔探測器。
HP 的 TCD 偵測器可以熱清潔。具體方法為：關閉偵測器，將層析管從偵測器連接器上取下，用死塊堵住柱箱內偵測器的連接器，設定參考氣體的流速。以20～30ml/min，設定偵測器溫度為400℃，熱清洗4～8h，冷卻後即可使用。
以下方法可用於國產或日產TCD檢測儀污染。儀器停止後，取下TCD的進氣口，用5ml注射器依進氣口注入丙酮（或甲苯，取決於樣品的化學性質）、無水乙醇和蒸餾水10～50次。用球慢慢地從進氣口吹出空氣，吹出雜質和殘留液體，然後重新安裝進氣接頭。接通電源後，將管柱溫升至200℃，檢測器溫度升至250℃，進行比值分析。載氣量比載氣量大1～2倍，直到基線穩定為止。
污染嚴重時，可用死塞堵住瓦斯出口。將進樣口充滿丙酮（或甲苯，取決於樣品的化學性質），保持約8h，排乾廢物，然後按上述方法處理。 。
FID偵測器清洗：FID偵測器使用穩定性好，使用要求相對較低，使用普遍。但在長期使用過程中，容易出現偵測器噴嘴、收集器積碳等問題，或有有機物等問題。噴嘴或收集器的沉積。對於 FID 沉積物或有機沉積物等問題，可以使用丙酮、甲苯或甲醇等有機溶劑清潔偵測器噴嘴和收集器。當積炭較厚無法清理時，可以用細砂紙仔細打磨探測器較厚的部分。打磨過程中請注意不要損壞探測器。初步打磨完成後，再用軟布進一步擦拭污染部分，最後用有機溶劑清洗，一般即可消除。
